Swiftで、Custom Viewなどに追加したサブビューを全部削除したい時、コマンド一つでは出来ないようです。
サブビューを一つ一つループで回して、削除していきます。
サンプルコードでは、cvという名前のCustom Viewを使っています。

//サブビューで列挙してループさせます。
for v in self.cv.subviews {
    //一つ一つサブビューを削除します。
    v.removeFromSubview()
}